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ithome 科技 教育 采集 2026-09-08T16:09:57+00:00

谷歌推出AlphaGenome Atlas,覆盖90亿种基因变异预测

原始标题:谷歌 DeepMind 推出 AlphaGenome Atlas,覆盖人类基因组全部 90 亿种单核苷酸变异预测

来源
ithome
发布时间
2026-09-08T14:20:07
采集批次
2026-09-08-16
字数
1169
URL 指纹
130452e3e958900d

📌 AI 总结(282 字)

谷歌DeepMind发布AlphaGenome Atlas平台,预计算AI模型AlphaGenome的全部预测结果,构建覆盖人类基因组90亿种单核苷酸变异的分子效应图谱,数据规模达1PB。该平台同步推出AVI评分,融合AlphaGenome与AlphaMissense优势,将变异影响浓缩为单一数值,便于研究人员快速排序。AVI评分在编码区与非编码区均适用,在致病性和罕见疾病基准测试中表现优异。博德研究所团队借此发现与癫痫性脑病相关的DNM1基因变异,埃克塞特大学分析5.4万名英国生物样本库参与者数据,多发现22%的非编码基因关联。该平台已向学术研究免费开放。
📄 正文(1169 字)
IT之家 9 月 8 日消息,谷歌今日推出AlphaGenome Atlas,这一平台包含了人类基因组中90 亿种单核苷酸变异(所有可能的单字母 DNA 改变)的功能预测,是目前涵盖基因突变对分子生物学影响最全面的目录,学术界可通过免费门户网站免费使用。

DNA 是生命的语言,掌握其密码能够改变人类理解生物学和治疗疾病的能力,但解读基因变异对分子层面的影响长期存在瓶颈:人类基因组有约 90 亿种可能的单字母突变,在实验室逐一测试几乎不可能。

根据介绍,谷歌 DeepMind 此前已经推出 AI 模型AlphaGenome,可以预测基因变异对生物过程的影响,可用于分析特定变异并在研究中得到广泛应用,此次通过大规模预先计算 AlphaGenome 的预测结果,构建出覆盖全基因组变异的全景资源库,就像地图集汇总地理信息一样,绘制出全基因组 DNA 变异的分子效应图谱。

为帮助科学家快速找到影响最大的遗传改变,谷歌同时发布了AlphaGenome Variant Impact(AVI)评分,该评分结合了 AlphaGenome 和 AlphaMissense两个模型的预测优势,将预测结果浓缩为单个数值,研究人员可以快速对变异进行排序,同时解读其分子效应。

AlphaGenome Atlas 是一个规模达 1 PB 的数据集,比 AlphaFold 数据库大 30 倍以上。该平台提供多个互相联动的资源:分子效应预测涵盖数百种人类和小鼠细胞类型与组织;AVI 评分为描述每个遗传变异影响的单一数值;AVI 特征归因关联到驱动其结果的特定生物学特征;DNA 序列基序包含超过 2500 个重复性 DNA 序列及其位置的完整合集。

AVI 评分同时适用于编码区(占基因组 2%)和非编码区(占基因组 98%,容纳绝大多数性状相关变异),帮助研究人员根据潜在影响快速对变异进行评分和排序。测试显示,AVI 评分在多种变异致病性和罕见疾病基准测试中都展现出一流性能。

目前外部合作研究团队已经借助 AlphaGenome Atlas 取得多项实际成果:在罕见病研究中,博德研究所团队借助 AVI 评分筛选变异,发现了此前被忽略的、与癫痫性脑病密切相关的 DNM1 基因变异,实验验证确认了该预测结果;埃克塞特大学研究人员对英国生物样本库超过 54000 名参与者的全基因组数据进行分析,通过 AlphaGenome Atlas 发现了多 22% 的非编码基因关联,精准定位了调控关键蛋白质水平的特定变异。

AlphaGenome Atlas 今起通过门户网站、AlphaGenome API 向学术研究开放,也可作为技能在 Google Antigravity 使用,非商业研究可免费获取,后续还将在谷歌云开放商业使用权限。